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公司商标申请可以通过以下三种方式进行：
自行提交申请：申请人可以前往商标局营业大厅自行提交申请，或者通过网上提交申请。自行提交申请需要准备齐全的申请材料，包括公司营业执照复印件盖公章、商标小类（10个产品）、商标图样等。
委托代理机构提交申请：申请人可以委托商标代理机构提交申请，由代理机构进行申请流程的跟进和材料的准备。代理机构会根据具体情况提供相应的服务，并在商标注册期间内收发重要文件，确保注册流程的顺利进行。
寻找商标代理机构进行注册：申请人可以寻找商标代理机构进行注册，由代理机构进行商标注册的全面服务，包括排查商标的通过率、提出修改建议、按商标局标准准备材料等。代理机构会在注册期间内提供全面的服务，确保注册流程的顺利进行。
需要注意的是，商标申请需要遵守相关法律法规和程序要求，确保申请的合法性和有效性。同时，不同的申请方式会有不同的优缺点，申请人可以根据自身情况和需求选择合适的申请方式。