公司申报纳税的流程一般包括以下步骤：
1. 纳税登记：公司在领取营业执照后30天内，带上相关证件和材料去税局办理税务登记，税局收到企业的相关材料后自申报日起30天内审核并发给单位企业税务登记证。
2. 税务认定：确认纳税人是一般纳税人还是小规模纳税人，确认企业征收税款的方式是什么，是查账征收、核定征收还是代扣代缴等，这些都是单位和税局共同决定的。
3. 发票和税盘：已经核税的企业可以向税务机关购买税控盘零购发票，依据公司业务开具发票了。
4. 报税：报税的方式一般分两种：上门申报和网上申报。上门申报也叫直接报税，非常常见的就是企业外派财务携带相关材料亲自到税务部门去填报各项税单，然后缴纳税款。随着互联网的普及越来越多的公司适用网上申报的方式，这种方式只要通过进入网上办税服务厅官网后填写企业相关纳税信息，报送税款，按时扣款即可。
5. 完税证明：在企业成功纳税以后，在税务大厅可以收到完税凭证，如果是网上报税可以去税务机关要求提取完税证明。
以上就是公司申报纳税的基本流程，具体流程可能因地区和具体情况而有所不同。在操作过程中遇到问题，建议咨询专业税务人员或机构以获得帮助。