香港公司年审逾期罚款的计算方式主要有两种。首先，商业登记证每年年审时会更换新的，如果逾期未进行年审，将会有300港币的罚款。其次，年报是按逾期的时间来进行罚款的，例如如果在成立为法团的周年日后的42天内没有提交周年申报表，将根据逾期时间产生相应的罚款。
具体的罚款金额会随着逾期时间的延长而增加。以逾期四十天为例，需要支付的罚款为870港币。如果逾期超过一年，则每一年都会依据300港币的商业登记证罚款和根据其逾期时间计算的年报罚款进行处理。
请注意，即使香港公司没有任何运作行为，也需要按时办理周年报表和商证续费，否则也将会面临罚款。为了避免这些不必要的支出，强烈建议及时进行年审。如果您觉得这个过程复杂或者难以操作，可以考虑委托代理秘书公司来办理，只需要提供相关的资料信息即可。